南京林业大学是全国首批具有博士和硕士学位整体授予权的高校。现有11个博士学位授权一级学科点、2个博士专业学位授权点，28个硕士学位授权一级学科点和20个硕士专业学位授权点，构建形成林科特色生态文明学科体系。现有林业工程国家“双一流”学科建设点1个；一级学科国家重点学科2个，二级学科国家重点学科4个；江苏省一级学科国家重点学科培育点1个，江苏高校优势学科8个，国家林业和草原局重点学科13个，江苏省重点学科10个；建有江苏高校“生物质先进功能材料学科交叉中心”。在第四轮学科评估中，林业工程、林学获评A+、风景园林学获评A-。工程学、化学、农业科学、植物与动物科学等4个学科进入ESI全球机构排名前1‰，材料科学、环境生态学、生物与生物化学、地球科学、社会科学总论和计算机科学等6个学科进入ESI全球机构排名前1%，形成了高峰高原学科协调高质量发展新格局。

现有博士生导师356人，具有高级职称人员1163人，中国工程院院士2名，发达国家工程院院士1名，其他国家级人才38人，享受国务院政府特殊津贴专家14人，全国黄大年式教师团队4个，国家级教学名师2人，全国模范教师1人，国家级优秀教学团队1个，国家级课程思政教学名师和教学团队各1个。省部级突出贡献中青年专家14人，江苏省“333工程”第一层次首席科学家4人，省“333工程”二、三层次、“青蓝工程”“六大高峰”等各类省级人才计划570余人，省部级教学名师11人，江苏省科技创新团队及“青蓝工程”等省级创新团队27个。